Лунин обвиняется в нескольких преступлениях по четырем статьям: «превышение полномочий», «получение взятки», «служебный подлог» и «подделка документа». По версии следствия, в 2010 и 2011 году управленец незаконно отдал в аренду 26 участков из земель, государственная собственность на которых не разграничена. Кроме того, в 2011 году Лунин незаконно подписал разрешение на строительство многоквартирных домов и детского сада, несмотря на запрет Думы города.
Следствием также установлено, что с 2009 по 2011 год обвиняемый неоднократно получал взятки от предпринимателей и жителей края за предоставление земли в сумме от 450 тысяч до 2,5 миллионов. В настоящее время материалы его уголовного дела находятся в суде.
Городская Дума рассмотрела заявление Лунина об уходе по собственному желанию и приняла решение досрочно прекратить его полномочия. В настоящее время обязанности главы Михайловска временно исполняет Михаил Миненков.